SeqAn3
3.4.0
The Modern C++ library for sequence analysis.
Toggle main menu visibility
Loading...
Searching...
No Matches
Here is a list of all documented namespace members with links to the namespaces they belong to:
- a -
advanced :
seqan3
align_pairwise() :
seqan3
alignment_from_cigar() :
seqan3
alphabet_char_t :
seqan3
alphabet_phred_t :
seqan3
alphabet_rank_t :
seqan3
alphabet_size :
seqan3
aminoacid_similarity_matrix :
seqan3
assign_char_strictly_to :
seqan3
assign_char_to :
seqan3
assign_phred_to :
seqan3
assign_rank_to :
seqan3
async_input_buffer :
seqan3::views
at :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
- b -
back :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
bi_fm_index() :
seqan3
- c -
char_is_valid_for :
seqan3
char_strictly_to :
seqan3::views
char_to :
seqan3::views
chunk :
seqan3::views
cigar_from_alignment() :
seqan3
collection :
seqan3
common_pair :
seqan3
common_tuple :
seqan3
complement :
seqan3
,
seqan3::views
compressed :
seqan3
concat :
seqan3::list_traits
contains :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
convert :
seqan3::views
count :
seqan3::pack_traits
count< query_t, type_list< pack_t... > > :
seqan3::list_traits
- d -
data_layout :
seqan3
debug_stream :
seqan3
default_configuration :
seqan3::search_cfg
default_sdsl_index_type :
seqan3
dna15q :
seqan3
dna4q :
seqan3
dna5q :
seqan3
drop :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
drop_front :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
drop_last :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
- e -
edit_scheme :
seqan3::align_cfg
elements :
seqan3::views
enable_aminoacid :
seqan3
enforce_random_access :
seqan3::views
enumeration_names :
seqan3
erase_gap() :
seqan3
- f -
field :
seqan3
find :
seqan3::pack_traits
find< query_t, type_list< pack_t... > > :
seqan3::list_traits
find_if :
seqan3::pack_traits
find_if< pred_t, type_list< pack_t... > > :
seqan3::list_traits
fm_index() :
seqan3
fmtflags2 :
seqan3
from_chars() :
std
front :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
- g -
gap_decorator() :
seqan3
gapped :
seqan3
genetic_code :
seqan3
get() :
seqan3
- h -
hardware_constructive_interference_size :
std
hardware_destructive_interference_size :
std
hidden :
seqan3
- i -
insert_gap() :
seqan3
interleave :
seqan3::views
is_alpha :
seqan3
is_blank :
seqan3
is_char :
seqan3
is_cntrl :
seqan3
is_config_element_combineable_v :
seqan3
is_digit :
seqan3
is_eof :
seqan3
is_in_interval :
seqan3
is_lower :
seqan3
is_pair_close :
seqan3
is_pair_open :
seqan3
is_print :
seqan3
is_space :
seqan3
is_unpaired :
seqan3
is_upper :
seqan3
is_xdigit :
seqan3
- j -
join_with :
seqan3::views
- k -
kmer_hash :
seqan3::views
- m -
max_pseudoknot_depth :
seqan3
minimiser :
seqan3::views
minimiser_hash :
seqan3::views
- o -
on_result() :
seqan3::align_cfg
,
seqan3::search_cfg
operator""_cigar_operation() :
seqan3::literals
operator""_db3() :
seqan3::literals
operator""_dna15() :
seqan3::literals
operator""_dna16sam() :
seqan3::literals
operator""_dna3bs() :
seqan3::literals
operator""_dna4() :
seqan3::literals
operator""_dna5() :
seqan3::literals
operator""_dssp9() :
seqan3::literals
operator""_phred42() :
seqan3::literals
operator""_phred63() :
seqan3::literals
operator""_phred68solexa() :
seqan3::literals
operator""_phred94() :
seqan3::literals
operator""_rna15() :
seqan3::literals
operator""_rna4() :
seqan3::literals
operator""_rna5() :
seqan3::literals
operator""_shape() :
seqan3::literals
operator""_tag() :
seqan3::literals
operator""_wuss51() :
seqan3::literals
operator|() :
seqan3
option_spec :
seqan3
output_file_open_options :
seqan3
- p -
pairwise_combine :
seqan3::views
parallel :
seqan3::align_cfg
,
seqan3::search_cfg
pow() :
seqan3
pseudoknot_id :
seqan3
- r -
range_dimension_v :
seqan3
range_innermost_value_t :
seqan3
rank_to :
seqan3::views
repeat :
seqan3::list_traits
,
seqan3::views
repeat_n :
seqan3::views
replace_at :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
required :
seqan3
rna15q :
seqan3
rna4q :
seqan3
rna5q :
seqan3
- s -
sam_flag :
seqan3
sdsl_wt_index_type :
seqan3
search() :
seqan3
seqan3_version :
seqan3
seqan3_version_cstring :
seqan3
seqan3_version_major :
seqan3
seqan3_version_minor :
seqan3
seqan3_version_patch :
seqan3
single :
seqan3
single_pass_input :
seqan3::views
size :
seqan3::pack_traits
size< type_list< pack_t... > > :
seqan3::list_traits
slice :
seqan3::views
small_vector() :
seqan3
split_after :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
standard :
seqan3
- t -
take :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
take_last :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
text_layout :
seqan3
to_char :
seqan3
,
seqan3::views
to_chars() :
std
to_lower() :
seqan3
to_phred :
seqan3
to_rank :
seqan3
,
seqan3::views
to_upper() :
seqan3
transform :
seqan3::list_traits
,
seqan3::pack_traits
translate :
seqan3::views
translate_join :
seqan3::views
translate_single :
seqan3::views
translate_triplet() :
seqan3
translation_frames :
seqan3
trim_quality :
seqan3::views
tuple_pop_front() :
seqan3
tuple_split() :
seqan3
type_reduce :
seqan3::views
type_reduce_t :
seqan3
- u -
uncompressed :
seqan3
update_notifications :
seqan3
- v -
validate_char_for :
seqan3::views
- z -
zip :
seqan3::views
Hide me
Version:
Generated on
for SeqAn3 by
1.17.0